Trakya Üniversiteler Birliği Üst Kurulu aşağıdaki gibidir:
- Prof. Dr. Bülent ŞENGÖRÜR, Kırklareli Üniversitesi Rektörü-TÜB Üst Kurul Dönem Başkanı
- Prof. Dr. Erhan TABAKOĞLU-Trakya Üniversitesi Rektörü
- Prof. Dr. Sedat MURAT-Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi Rektörü
- Prof. Dr. Mümin ŞAHİN-Tekirdağ Namık Kemal Üniversitesi Rektörü
- Prof. Dr. Süleyman ÖZDEMİR-Bandırma Onyedi Eylül Üniversitesi (Katılımcı Üye)